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植物基因家族鉴定期刊下载_基因检测(2024年11月最新版)

内容来源：合毅科技所属栏目：新闻更新日期：2024-11-27

植物基因家族鉴定期刊

深圳大学分享：大数据时代的生物学前沿这周五，我应邀前往深圳大学，为生物学专业的研究生们带来了一场精彩的讲座。我分享了大数据时代下如何解决生物学问题，以及数据库在其中扮演的重要角色。为了更直观地解释，我举了两个植物学的案例。数据库与数据：艺术馆与艺术品的关系 𐟎芊在生物学中，物种的信息可以通过五个维度的数据来定义：基因组、基因注释、转录组、变异数据和泛基因组。数据库的生物信息学研究人员就像艺术馆的策展人，他们的工作是整理和分类这些数据，让科研人员和商业公司更方便地从中提取所需知识。探究生物学问题的关键：比较 𐟔 在生物学研究中，“比较”是一个非常重要的工具。想要探究某个物种特征背后的机理和规律，就需要将其与另一个对立性状的样品进行比较。例如，探究花对称性的形成原因时，我们需要比较两侧对称花与辐射对称花的数据。研究腐生植物时，则需要比较腐生植物与非腐生植物的数据。在大数据时代，比较基因组学是一种有效的路径。案例一：兰科植物对称性的进化 𐟌𘊊达尔文认为，兰科植物从辐射对称向两侧对称进化，花对称性的变化使得兰科植物吸引更多不同种类的传粉昆虫，协同进化推动了兰科物种数量的爆发。通过比较深圳拟兰（辐射对称）与蝴蝶兰（两侧对称）的基因组数据，我们发现MADS-box基因家族的差异是导致兰科植物雌雄同体以及具有特化唇瓣的能力的关键。而且，基因组比较显示，兰科植物应该是由两侧对称向辐射对称演化，这修正了达尔文的理论。案例二：植物菌根共生的进化 𐟌🊊90%的植物都有菌根，其中一部分完全依赖真菌提供营养，这就是腐生兰花。通过比较完全腐生的兰花（紫金舌唇兰 Platanthera zijinensis）和部分菌根共生的兰花（广东舌唇兰 Platanthera guangdongensis），我们揭示了腐生兰花失去光合作用能力，失去叶片和根部，在黑暗中生存的分子机制。通过这些案例，我希望能够激发学生们对生物学前沿领域的兴趣，并鼓励他们积极探索未知的世界。

生物进化中的全基因组复制：从基础到应用 𐟧쥅襟𚥛 组复制（Whole Genome Duplication; WGD）是指一个生物体的整个基因组被成倍扩增的现象。这一过程在多个物种的演化中发挥了重要作用。最早提出这个概念的是Susumu Ohno，他在1970年认为基因组复制产生的冗余基因通过新功能化（Neofunctionalization）推动了生物体复杂性的演化。到了20世纪末，随着完整基因组测序的完成，科学家首次通过基因组分析直接发现了全基因组复制的证据。之后，随着基因组测序在脊椎动物、植物和其他真核生物中的普及，WGD 被确认为一种普遍的演化机制。驱动基因多样性基因冗余：WGD 事件产生了大量的冗余基因，这些基因可以在不损害原始功能的前提下自由演化。新功能化：一些冗余基因在功能上分化，承担了新角色。例如，在植物中，调控花发育的MADS-box基因家族与多次WGD有直接关联。功能细化（Subfunctionalization）：冗余基因分担了原基因的功能，增强了生物的调控精度和生存适应性。增强抵抗力：冗余基因提供了基因储备，使物种在面临环境突变或灭绝事件时具有更大的生存优势。促进物种多样化快速辐射：WGD 经常与物种的快速辐射相联系。例如，被子植物的起源和白垩纪快速辐射与两次WGD事件直接相关。增强复杂性：调控网络的复杂化：WGD 通过增加基因数量，促进了基因调控网络的复杂化。例如，脊椎动物的免疫系统和神经系统的进化被认为与早期WGD事件密切相关。新器官的演化：被子植物的花、脊椎动物的颌和四肢的起源可能都受益于WGD提供的基因多样性。广泛应用谱系关系解析：WGD 提供了演化时间的分子证据，有助于重建物种的系统发育关系。生物资源与育种：畜牧业、农业、渔业、酿造业等运用生物资源的产业，通过人工选择或自然发生的WGD极大提高了产量和适应性。合成生物学：在人工设计的生物系统中，可以通过模拟WGD生成多拷贝基因，从而提高特定基因产物的表达效率。医学研究：研究WGD的机制有助于理解癌细胞如何通过基因组不稳定性获得快速增殖能力。除此以外，病原体基因复制往往与其抗药性相关。研究这些机制有助于设计针对多拷贝基因的抑制剂。

夏日晚餐｜清爽家常菜，吃不腻的美味今天的菜单𐟍𝯸： 1️⃣ 香菜拌牛肉 2️⃣ 丝瓜炒虾仁 3️⃣ 家常豆腐 4️⃣ 清炒红薯叶 𐟌ž 夏天除了空调和西瓜，当然少不了清爽又营养的家常菜啦！我家的食用油也换成了清淡适口的多力压榨玉米胚芽油。大家庭的餐桌，健康与安全并重！多力——拥有21年食用油精研经验的大品牌，是我不二的选择！这款油口感清爽，煎炸烹炒各种食材都能还原食材的鲜美本味～经常要给家人准备一大桌子菜，做饭过程中难免产生很多油烟，对自己和家人身体都会有影响，多力压榨玉米油使用的降低油烟技术就成了我的最爱，获得国家专利认证，减少油烟负担，厨房也更干净！家里有老人小孩的也可以放心吃，原料是自然的非转基因玉米，≥6000ppm植物甾醇、富含维生素E、亚油酸，无形之中呵护全家人的心健康！中国发明专利专利号: ZL 2022 1 1124686.6 发明名称: 降低精炼食用植物油油烟量的生产工艺及过渡装置

李子柒的漆艺：为何会过敏？终于等到了李子柒的更新，已经三年没见她家的院子了，还是那么熟悉的感觉。这次她分享了做漆艺的经历，用到了漆树的原料。漆树属于漆树科，树干韧皮部可以割取生漆，这种漆防腐、防锈效果极佳。除了树皮，漆树的种子油还能制油墨、肥皂；果皮可以提取蜡，用来做蜡烛、蜡纸；叶子可以提取栲胶，根和叶还能作土农药；木材则用于建筑。那么，为什么漆树会让人过敏呢？原来漆树的乳液中含有漆酚，这种物质会引起过敏性皮肤红肿、痒痛、丘疹等症状。如果误食，还会引起呕吐、疲倦、瞳孔放大、昏迷等中毒症状。我第一次见到漆树是在大学校园背后的老板山上。当时树木学老师特别提醒我们，对漆树过敏的人，即使只是站在树下一会儿，甚至“吹过漆树吹过的风”都会出现红肿痛痒的症状。所以，如果你对吃芒果都过敏，那最好还是远离漆树吧！今年去云南，在片马口岸的一个早餐店看到有漆油荷包蛋，我差点就尝了一口，幸好被有经验的老板和当地人劝住了。漆油荷包蛋可不是随便能尝的，最好还是不要贸然尝试。为什么可以用对芒果过敏来预防对漆树过敏呢？因为芒果也是漆树科植物，虽然它属于杧果属，但通过基因组测序发现，芒果和漆树都有一个与漆酚合成相关的CHS基因家族。除了漆酚，芒果还有一些潜在的过敏原，比如34 kDa蛋白和柠檬烯等，这些也是造成一部分人群对芒果过敏的原因。总之，能大口吃芒果真是太幸运了……

风景园林植物方向必读基础书籍推荐嘿，风景园林学植物方向的小伙伴们，准备好了吗？如果你已经顺利录取，那么恭喜你，接下来你将开启一段充满挑战和乐趣的学术旅程。为了不让你在开学后手忙脚乱，我强烈建议你提前准备一些基础书籍，打好基础。相信我，这些书会让你在未来的学习和研究中受益匪浅。植物学：基础中的基础 𐟌🊦䍧‰饭榘謹Ž景园林学的基石，无论你的研究方向是什么，植物学都是你绕不开的一门学科。熟悉植物的结构、生长习性、分类等等，会让你在后续的研究中如鱼得水。分子生物学：现代研究的趋势 𐟌𑊩š着科技的发展，分子生物学已经成为风景园林学的重要研究方向。从基因编辑到分子标记，分子生物学技术的应用越来越广泛。如果你对这方面感兴趣，那么这本书籍绝对值得一读。植物基因组学：探索植物的基因奥秘 𐟌𑊥悦žœ你的课题组正在研究植物基因组，那么这本书将是你的得力助手。通过了解植物基因组的结构和功能，你可以更深入地探索植物的生长和发育机制。植物生理学：实验设计的基础 𐟌🊦䍧‰駔Ÿ理学是植物学和分子生物学之间的桥梁。通过学习植物生理学的实验方法和原理，你可以更好地设计和执行自己的实验。这本书籍会让你对植物生理学的实验设计有一个全面的了解。分子系统发生学：了解植物的系统进化 𐟌🊥悦žœ你对植物的系统进化感兴趣，那么这本书籍将为你提供宝贵的参考。通过了解植物的系统进化关系，你可以更深入地理解植物多样性的起源和演化。生物信息学：基因组和基因家族的探索工具 𐟌𑊧”Ÿ物信息学是现代生物学研究的重要工具。如果你正在研究植物基因组或基因家族，那么这本书籍将为你提供强大的技术支持。通过学习生物信息学的原理和方法，你可以更高效地处理和分析基因组数据。其他书籍：向师兄师姐请教 𐟓š 当然，风景园林学的研究领域非常广泛，以上几本书籍只是基础中的一部分。你可以向你的师兄师姐请教，了解更多适合你的书籍。文献阅读：从基础开始 𐟓„ 不建议一开始就直接阅读文献。先打好基础知识，阅读几本书籍后，再尝试阅读一些文献。这样你会更有条理，也能更好地理解和吸收文献中的内容。学习软件：提前准备 𐟒𛊥悦žœ你后期需要用到一些分析软件，那么现在就可以开始学习。掌握这些软件的使用方法，会让你在后续的研究中更加得心应手。慕课和小破站：在线学习资源 𐟓š 当然，如果你不想阅读书籍，也可以选择在线学习资源。慕课和小破站上有许多优秀的课程，可以帮助你快速入门和提升。总之，风景园林学植物方向的研究需要你打好坚实的基础，多读几本书，多掌握一些技能，未来的路会更加顺畅。加油，小伙伴们！𐟒ꀀ

【「我科学家发现调控茶树香气与抗寒新机制」】10月17日，记者从安徽农业大学获悉，该校宋传奎教授、夏恩华教授等科研人员联合相关单位共同发现了调控茶树香气品质与抗寒的新机制。相关研究成果日前刊发在国际权威期刊《植物细胞》上，这也是全球茶学领域在该刊发表的首篇文章。茶树是我国重要的经济作物，干旱、低温等因素严重影响茶叶的品质与产量。研究发现，茶树基因组在大约3000万年前发生过一次近期的全基因组加倍事件，导致诸如糖基转移酶（UGTs）等与茶叶品质和抗逆性相关的基因家族在茶树中发生快速扩增。然而，目前尚未有关于茶树UGTs基因加倍后功能分化影响茶叶品质和抗逆性的报道。为了更好地理解UGTs如何影响茶叶品质和茶树的抗逆性，研究团队深入探究了茶树UGTs基因演化的奥秘。研究人员通过对28种植物的UGTs进行系统分析，首次揭示了茶树中UGTs家族成员的独特扩张和收缩模式。以“舒茶早”品种茶树为例，这个家族拥有297个成员，可以分为18个不同的亚家族。其中，G亚家族和H亚家族的扩张和收缩现象尤为突出。H亚家族中的成员数量在不同茶树品种间有所减少，特别是在“舒茶早”品种中，仅剩下一个拷贝，这个拷贝对于提高茶树抵抗真菌病害的能力至关重要。而G亚家族在扩张过程中则出现了显著的功能分化，尤其是在抗寒和抗旱方面。例如，G亚家族中的两个成员，UGT85A53和UGT1，都能选择相同的挥发性化合物作为底物，但它们对植物激素的选择性却有所不同。这种选择性的差异让这两个基因能够分别正面和负面地调节茶树的抗寒性和抗旱性，从而帮助茶树适应不同的环境条件。此外，研究团队还发现了人工选择对茶树G亚家族中某些UGTs的影响，这些基因更偏向于增强茶树香气品质和抗寒能力，但在抗旱性上则无明显作用。这表明，人们在茶树育种过程中更倾向于选择有助于香气和耐寒性的基因。研究人员表示，这一发现对于未来的茶树育种工作具有重要意义。它不仅有助于培育出更优质、更能抵抗恶劣环境的茶树品种，也为其他作物的品质和抗性协同选择提供了新思路。（科技日报）

留学生生物信息学指导：从基础到前沿 𐟌 留学生生物信息学指导，涵盖生物化学、分子生物学、微生物学、细胞生物学、生物学导论、动物学、植物学、基础化学、营养学等多学科领域。提供实验技能指导，如荧光定量PCR、蛋白免疫印迹（Western Blot）、基因家族分析等。 𐟔젥ꌥˆ†析：包括样本分析、数据挖掘、数据清理、基因注释、差异分析等，提供全面的生物信息学解决方案。 𐟓Š 数据可视化：利用D3.js、Vega等工具进行数据可视化，帮助科研成果作图。 𐟒Š 药代动力学（PK）：进行药物代谢研究，探索药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄过程。 𐟌🠨倫覤物学：研究药用植物的药理作用和化学成分，为药物研发提供基础。 𐟔砥ˆ†子对接：利用计算机模拟技术，预测药物与靶点之间的相互作用。 𐟓ˆ 同源建模：通过已知结构的蛋白质模板，构建未知结构的蛋白质模型。 𐟔 虚拟筛选：利用计算机筛选技术，快速发现具有特定生物活性的化合物。 𐟓š 生信分析：提供个性化的生物信息学分析服务，挖掘数据并提供创新思路。 𐟌𑠦䍧‰饭毼š研究植物的形态、生理、遗传和进化等，为农业和环境保护提供科学依据。 𐟐 动物学：探索动物的多样性和适应性，了解它们与环境的相互作用。 𐟌ˆ 生物化学：研究生命的化学基础，包括蛋白质、核酸、酶等生物大分子的结构和功能。 𐟔젥𞮧”Ÿ物学：研究微生物的种类、习性、代谢途径和生态作用。 𐟌🠧𛆨ƒž生物学：探索细胞的结构、功能和生命周期，了解细胞与组织的关系。 𐟓Š 基础化学：涵盖无机化学、有机化学、物理化学和分析化学等多个领域。 𐟍𝯸 营养学：研究食物的营养成分和人体对营养素的吸收和利用。

转座子：基因组中的小魔法师 𐟧™♂️ 转座子（Transposable Element，TE）是基因组中的一种神奇元件，它们可以在基因组中自由移动。这些小家伙在物种进化中可是功不可没哦！比如，从大刍草进化到玉米的过程中，一个转座子的插入就增强了控制顶端优势的TB1基因的表达，让玉米长得更高更壮。转座子主要分为两大类：反转座子和DNA转座子。反转座子就像复制粘贴一样，产生新的转座子拷贝；而DNA转座子则通过剪切复制的方式进行转座。Helitrons是通过滚环的方式进行转座的，其他类型的DNA转座子则采用剪切复制的模式。在植物中，I型转座子亚家族的Copia和Gypsy是最常见的转座子类型，它们占据了玉米基因组的70%！这些逆转录转座子通过“复制-粘贴”的方式，可以在短时间内快速增加大量拷贝，从而扩大基因组的规模。转座子在植物基因组中扮演着重要角色，它们不仅参与了物种的进化，还可能影响到植物的生长发育。了解这些小家伙的工作原理，或许能为我们揭示更多关于植物生命的奥秘呢！

36岁，我在丽江维西县塔城的那些日子从2007年开始，我就一直在路上。很多人问我，出走是为了逃避现实吗？其实，我觉得“逃避”这个词太沉重了。不如说，出走是为了换换气。我就像是一条水生生物，时不时得浮出水面，才能呼吸自如，否则就快要崩溃了。也许，出走是刻在母系家族基因里的，仿佛有一种召唤。一个人在路上的好处是，有大把时间可以专注于阅读和思考，暂时屏蔽外界的喧嚣，切断与熟人的联系。这样的时刻，仿佛置身于一个真空气泡中。但同时，一个人在路上也是观察的好时机。我会观察人们的劳作，捕捉他们的微表情，洞悉他们行为背后的动机。我也乐此不疲地观察鸟类、植物、山脉，甚至和原住民聊天，一起分享食物。在这两种状态中切换，虽然疲惫却也饱满，能量逐渐充足起来，留到回归城市时再消耗。

DAP-seq常见问题解答，一文搞定！ 1. 𐟔 DAP-seq技术原理与流程技术原理：DAP-seq通过体外表达蛋白与DNA进行亲和纯化，洗脱后进行高通量测序，从而找到转录因子的结合位点。技术流程：构建含有亲和标签的载体，体外表达转录因子与亲和标签的融合蛋白，提取基因组DNA并构建DNA文库。将体外表达的转录因子与DNA文库结合，洗脱后上机测序。解决的问题：快速定位转录因子的结合位点，发现转录因子调控的靶基因。 𐟓š 所需材料组织材料或提取好的基因组DNA 目标蛋白质粒（含有完整目标蛋白序列的质粒，如转录因子） 𐟓ˆ 实验成功率不同转录因子家族的成功率有所不同，具体成功率可参考相关资料。 𐟔„ 重复次数实验包含两个技术重复，以确保结果的可靠性。 𐟌𑠦䍧‰駻„织样本要求植物组织样本的取样时期和部位根据研究需求确定，不同组织和时期DNA的修饰可能影响蛋白与DNA的结合。 𐟔전AP-seq与ChIP-seq的区别 DAP-seq不需要针对每个转录因子制备特异性抗体，具有快速、高通量和节约时间成本的优势。 𐟓Š Input对照 Input对照用于降低背景噪音，是亲和纯化前的文库。 𐟓Œ Peak数目少的结果可用吗？虽然DAP-seq的peak数目较少，但建议仍然对现有结果进行分析，可能挖掘出亮点结果。 𐟔젩ꌨAP-seq结果 DAP-seq结果一般需要验证，验证手段包括EMSA、酵母单杂等实验。如果通过前期大量转录因子筛选出候选转录因子，也可以考虑体内ChIP等验证。

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