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重测序论文前沿信息_5%的查重率意味着什么(2024年12月实时热点)

内容来源：合毅科技所属栏目：教程更新日期：2024-12-01

重测序论文

如何用单细胞技术发表高分文章？单细胞分析近年来成为科研热点，其研究进展迅速，吸引了大量科研人员。以“Single-Cell RNA Sequencing”为关键词在PubMed上搜索，截至2023年已发表超过20693篇研究论文。单细胞测序技术在肿瘤、免疫、传染病及细胞进程研究等各个生命科学领域中迅速发展，其精准的分析能力和广泛的应用潜力吸引了科研和临床研究人员的关注。单细胞测序的流程包括：单细胞捕获、单细胞裂解、遗传物质的提取扩增、文库构建、测序与数据处理。虽然相对于传统测序技术更为复杂，但单细胞测序已经是一项成熟的技术。分析单细胞测序数据不仅是科研人员的基本技能，也成为发表高分文章的必备要素之一。Cell、Nature、Science等期刊上不同研究方向的单细胞测序文章层出不穷。掌握单细胞测序技术，不仅能帮助您更好地理解生命科学领域的研究，还能为您的科研工作带来更多可能性。

生物信息学个性化分析服务，满足不同需求！我们上海仟奥盈福生物科技有限公司由三位海归博士共同创立，专注于提供生物信息学的个性化分析服务。自成立以来，我们已经为众多客户提供了专业的解决方案。通过对客户需求的细致分析，我们发现需要生物信息学分析服务的人群主要可以分为三大类：学生、医生以及实验室PI或博士后研究员。 𐟎“ 学生群体学生群体通常面临毕业论文的压力，但可能在生物信息学分析方面缺乏必要的技能。大致可以分为两类： 1.1 有自己的单细胞测序数据，但缺乏分析能力，可能是完全不懂分析，或者虽有一定的分析基础，但缺乏熟练使用package和debug的能力； 1.2 没有自己的单细胞数据，需要通过TCGA或GEO数据库进行数据挖掘和分析。 𐟑颀⚕️ 医生群体医生群体可能因为日常工作繁忙，缺乏进行数据分析的时间。他们的情况也可以分为两类： 2.1 拥有资金和样本资源，比如基金资助和来自患者的样本（cancer/pbmc等等），但在送样后，缺乏分析、制图和撰写文章的时间； 2.2 缺乏样本资源，同样需要利用TCGA或GEO数据库进行数据挖掘和分析。 𐟔젧瑧 ”团队科研团队，尤其是那些规模较小的实验室，PI可能没有专业生信分析的学生或者RA。那么我们公司能够接收这些团队的测序数据，并提供个性化分析、答疑和无限次的修图服务。我们的服务不仅直接面向PI，也包括与博士后研究员的合作。一般情况下，PI或者博后，通常都拥有自己的测序数据，只是需要进行个性化的分析。

二代测序比对软件大比拼：哪款最适合你？今天我们来聊聊二代测序中常用的三款比对软件，它们在科研工作中各有千秋。 BWA：经典与现代的结合 𐟏† BWA（Burrows-Wheeler Aligner）是一个早期的比对工具，提供了三种不同的算法：BWA-MEM（用于单端和双端测序数据的全局比对）、BWA-SW（用于长读长的局部比对）、BWA-BACKTRACK（用于较短的reads）。你可以根据自己的需求选择合适的算法。虽然我个人使用频率不高，但它确实是经典中的经典。论文：Li, H., & Durbin, R. (2009). Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler transform. Bioinformatics, 25(14), 1754-1760. Bowtie2：高效与准确的代表 𐟚€ Bowtie2采用了一种叫做“比对树”的索引结构，实现高效的比对。它支持单端和双端测序数据的全局比对，也可以进行局部比对，速度较快，对比准确率也较高。不过，它没有处理剪切位点的功能，因此不适合用来转录组的比较。我个人一般在染色质测序数据（如ChIP-seq、ATAC-seq等）的比对中使用。论文：Langmead, B., & Salzberg, S. L. (2012). Fast gapped-read alignment with Bowtie 2. Nature Methods, 9(4), 357-359. STAR：转录组的得力助手 𐟌Ÿ STAR主要用于比对转录组测序数据，可以处理RNA-seq数据中的剪切事件，也能自动处理adapter。它功能丰富，比如可以直接输出gene counts，对bam排序等。如果你使用服务器且内存条件较好，它可以并行处理加快速度。如果你想用它比对染色质数据，在建立index时不要使用GTF，就不会考虑剪切事件，就可以应用在染色质比对数据上。论文：Dobin, A., Davis, C. A., Schlesinger, F., Drenkow, J., Zaleski, C., Jha, S., ... & Gingeras, T. R. (2013). STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner. Bioinformatics, 29(1), 15-21. 总结 𐟓 在平时的使用中，我个人会选择Bowtie2来处理染色质相关的比对，而STAR则是转录组比对的首选。希望这些信息能帮助你在选择比对软件时做出更明智的决策！

20个膝关节置换术论文选题推荐𐟔劤𛊥䩤𘺥䧥𘦦岰个关于膝关节置换术的论文选题，供大家参考。以下题目仅供参考，欢迎大家一起讨论！ 𐟔 止血带优化与倒刺线缝合对初次人工全膝关节置换术康复的影响 𐟏堥𝱥“初次单侧髋膝关节置换术术后住院时间的因素分析 𐟧젥Ÿ𚥛 组二代测序指导抗生素治疗人工全膝关节置换术后感染的疗效研究 𐟒‰ 淋巴细胞计数及百分比预测膝关节置换术后早期感染的价值 𐟒†‍♂️ 巨刺电针治疗人工全膝关节置换术后疼痛的临床观察 𐟛Œ 综合护理联合手术室护理在全膝关节置换术患者中应用效果 𐟓Š 日间全膝关节置换术患者自我报告结局对比及满意度影响因素分析 𐟌 平均轨迹误差、血清内毒素与CR假体全膝关节置换术后早期疗效的关系 𐟓 术后膝关节屈曲角度对全膝关节置换术后肢体肿胀、膝关节活动角度的影响效果对比 𐟓Š 基于症状管理理论的全膝关节置换术后疼痛与肿胀评价指标体系的构建 𐟑𕠨€年膝关节置换术后患者发生贫血的影响因素分析及预测模型构建 𐟏堥…訆关节置换术治疗伴关节外畸形的重度内翻膝骨关节炎 𐟒Š 肌内效贴联合芒硝冰袋冰敷对全膝关节置换术后患肢肿痛的影响 𐟔‹ 引流管夹闭方式对全膝关节置换术后失血及并发症的影响 𐟗️ 全膝关节置换术后发生膝前痛的相关因素分析 𐟍𒠨ƒ𖨉𞦱䦔𙥖„全膝关节置换患者术后贫血及膝关节功能的临床研究 𐟒Š 活血骨复汤联合功能训练对膝关节单髁置换术后远期膝关节功能康复转归患者的临床疗效 𐟏堥Œ𛦊䥺𗩙ꤸ€体化模式对骨科全膝关节置换术患者的影响 𐟧 全膝关节置换术患者术前心理一致感现状及其影响因素分析 𐟏‹️‍♂️ 膝关节单髁置换术治疗高龄骨关节炎患者的研究进展希望这些选题能给大家带来灵感！

2024年10月9日，北京大学黄晶、邱晓彦共同通讯在Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 在线发表题为“Hepatocyte-derived Igpromotes HCC progression by stabilizing electron transfer flavoprotein subunit to facilitate fatty acid oxidation”的研究论文，该研究结果表明，IgETFA轴解除了脂肪酸氧化的调控，促进了HCC的进展，这表明靶向脂肪酸代谢可能是一种有效的HCC治疗策略。肝细胞源性V-1/J-Ig糖𝦘C的一个有前景的治疗靶点。研究采用RT-PCR、Sanger测序、免疫组化、Western blot分析肝细胞源性Ig‡排序列及表达水平。通过siRNA或gRNA沉默不同HCC细胞系中的Ig𜌨𜰥…𖥜舃C肿瘤发生中的功能。为了评估Igœ訂细胞特异性Ig•𒩙䥒Œ二乙基亚硝胺（DEN）和四氯化碳（CCL4）诱导的HCC小鼠模型中在体内的作用。通过多组学分析、免疫荧光和代谢物检测等方法研究Ig𝱥“HCC肿瘤发生的分子机制。证实了Ig𜌧‰𙥈릘𚴭1/J-Igœ褺𚈃C细胞中高表达。在体外，Ig𜺥䱦Š‘制了HCC细胞的增殖和迁移，肝细胞特异性Ig𜺥䱦”𙥖„了DEN和CCL4诱导的肝癌小鼠体内的HCC进展。机制上，V-1/J-Ig𘎧”𕥭转移黄蛋白亚基(ETFA)相互作用，延缓其蛋白降解。Igš„缺失导致线粒体呼吸链复合物III和IV的表达降低，导致脂肪酸氧化（FAO）和脂质积累异常，从而抑制HCC细胞的增殖和迁移。「iNature」

3.3万年前至3千年，古人类之谜这篇论文来自付巧妹团队，发表在2021年的Cell正刊上。如果你对古人类起源感兴趣，可以看看我之前的“我们从哪里来”系列。首先，样本来源非常重要。之前欧洲以外地区的古人类遗骸样本非常缺乏。随着付巧妹、王传超等学者回国，中国样本逐渐被挖掘和分析。前几天还提到印度也开始相关挖掘工作。 DNA提取技术是个技术活，感兴趣的可以看看大卫赖克的书，全球也就几个团队能做到。到底分析什么？是常染色体、性染色体、覆盖的区域、SNP数量，还是微生物相关的数据？这些都决定了结果的丰富度和可信度。接下来简单看看这篇论文：这篇论文提取了曾生活在黑龙江松嫩平原、时间跨度为33,590–3,420年的25个古人类的骨头DNA，建库测序SNP覆盖率很参差，几万到几十万个SNP不等。虽然数据质量一般，但考虑到这么久远的样本，已经很难得了。其中重点对阿穆尔地区一位人类女性（AR33K）的基因组信息进行深度分析。这位女性预估是和田园洞人一支，目前还无法确认和现代中国人的关系密切程度。图3展示了25个古人类样本的分布，主要在现代的黑龙江地区，同时也直观对比了之前发表的附近古人类样本的地点。然后重点讲一个古人类研究里用的统计手段——四群体检验用于血缘亲疏关系。例如，图4显示与黑猩猩相比，尼安德特人的祖先曾发生一个突变T，而尼安德特人和欧洲人所共享的突变总量里，比非洲人的数目要多9%的T，则说明历史上尼安德特人和欧洲人祖先发生过混血。而和非洲人则说不好。付巧妹的研究也用了这个思路，并用f3 value来比较：f3(P1, P2, P3, 外群)，是研究P1（上面的尼安德特人）和P2（上面的欧洲人）两个人群是不是发生过混血，对比P3（类似上面的非洲人），和外群（上面的黑猩猩）。再来看结果：图5显示，颜色越深数字越小，混血比例越小。这里说明33K年前的AR33K女性和北京田园洞人发生最多的混血概率（距离1K公里以外！）。北京田园洞人也是如此。图6展示了AR33K和欧亚大陆上其他的古人类样本的血缘亲疏关系。另外还有一些结论，我们体感不强就不赘述了，例如：现代东亚人重要的EDAR基因上的V370A突变，是在约2W年前开始出现的，AR33K和田园洞人都没。这个突变可能用于补充乳汁中的维生素D含量或者调节体温出汗。 #我们从哪里来

博士申请？先定位学校！ 1. 𐟎“ 本科毕业于国内211药学院，GPA为3.0/5，排名大约在150/300，学校给分较为严格。 𐟎“ 研究生就读于日本一所QS排名前150的药学院，GPA全A无排名，非授课型，而是科研型。 𐟓 拥有一篇一作4分的小论文，两篇二作4分的论文，均与生物医学相关，未来计划申请该方向的博士。 𐟔젦ŽŒ握的技能包括常见的分子生物学实验，还有小鼠造模、干细胞培养、高通量药物筛选、小分子与蛋白相互作用检测等，能够使用R语言分析单细胞测序和转录组测序数据。 𐟓š 雅思成绩为6.5，但已过期，计划今年冲刺7.0。 𐟒𜠦𘚥Ž回国在大厂从事研发型工作两年，因硕士在研发岗天花板较低，决定读博。 𐟒𐠥𘌦œ›申请到提供奖学金的学校，博士毕业后计划进入当地医药公司或生物技术公司工作，最终移民。主要考虑加拿大、澳大利亚和德国，但不确定以自己的条件能申请到哪些学校。

生信定制，速发论文！ 𐟔 服务流程：方案设计：紧跟研究热点，提供新颖独特的方案。数据分析：处理原始数据，解读报告，提供录屏服务。文章框架：全英文撰写，指导写作，确保高质量交付。查重报告+润色：专业降重，确保文章独特性。 𐟌Ÿ 我们的优势：课题优势：个性化生信分析，花费少，时间短，易结题，高产。项目优势：利用测序数据库找到目标基因，通过大数据分析，起到预实验作用，结合实验设计完美课题。价格优势：公共数据库蕴藏大量未开发的“宝藏”，有效挖掘可节省大量实验经费。时间优势：生信分析无需实验，时间短，产出高。 𐟓š 如果您正在寻找生信分析服务，希望您考虑我们的服务，给我们一次机会，也给您多一份选择！

【学者研究发现粗叶榕染色体水平基因组】近日，中国科学院华南植物园研究员于慧团队在国家重点研发计划等项目的资助下，利用Illumina，PacBio HiFi及HiC等测序技术首次获得了粗叶榕染色体级别的基因组图谱。相关成果发表于《科学数据》（Scientific Data）。论文传送门☞网页链接粗叶榕又称五指毛桃，为桑科榕属的药食同源植物，是一种具有重要经济价值的植物。其根部为浅黄色，有香气，富含多种生物活性化合物，如黄酮类、苯丙素类和多糖等，这些成分在植物的抗病能力、适应环境变化以及药用价值上都扮演着关键角色。论文第一作者、中国科学院华南植物园在读博士研究生黄伟城表示，目前，对粗叶榕的基因组研究仍然相对较少，尤其是在其特定药用成分的生物合成途径方面。尽管已有部分关于粗叶榕基因组的初步研究报告，但这些研究大多集中于表型特征或叶绿体基因组，对于全基因组的深入解析仍显不足。为此，于慧团队利用Illumina，PacBio HiFi及HiC等测序技术首次获得了粗叶榕染色体级别的基因组图谱。其基因组总大小约为297.27Mb，scaffoldN50为19.71Mb，其中94.90%的序列被锚定到了13条染色体上。共注释到132.79Mb的重复元件，占比基因组的44.67%。通过从头预测、转录组测序和同源基因比对共鉴定到28625个蛋白编码基因，并成功获得其中92.39%基因的功能注释信息。论文通讯作者于慧表示，高质量的粗叶榕基因组为解析香豆素等次生代谢物生物合成的分子机制及药用有效成分的品质提升奠定前期基础。（来源：中国科学报朱汉斌周飞）

医学检验论文选题指南：灵感大放送！亲爱的医学检验小伙伴们，是不是正在为论文选题头疼呢？别急，今天我给大家带来一些超有创意的选题思路，保证让你的论文闪闪发光！临床检验基础：血常规、尿常规、粪便常规，这些我们每天都在做的检查项目，其实背后藏着很多秘密。比如，你可以探究血常规中不同指标在各种疾病中的变化规律，或者分析尿常规检测在泌尿系统疾病诊断中的价值。临床生物化学检验：肝功能、肾功能、心肌酶谱、血糖、血脂……这些检测指标和各种疾病息息相关。你可以深入研究它们在疾病诊断和治疗监测中的作用。临床免疫学检验：免疫球蛋白、补体系统、自身抗体、肿瘤标志物……这些指标在自身免疫性疾病、感染性疾病和肿瘤诊断中可是关键。深入研究它们，能为临床提供更精准的诊断依据。临床微生物学检验：细菌、真菌、病毒的培养与鉴定，耐药性监测以及医院感染的控制，这些都是超级热门的研究方向。临床血液学检验：血细胞形态学、骨髓细胞形态学、白血病的诊断与分型、贫血和出血性疾病的检查……这些对血液病的诊断和治疗意义重大。分子生物学检验：聚合酶链反应、基因芯片、核酸测序……这些新技术在肿瘤、感染性疾病和遗传病诊断中的价值，绝对值得深入研究。希望这些选题思路能给大家带来一些灵感，让我们一起为医学检验领域的发展贡献力量吧！𐟒ꊊ#医学检验 #论文选题 #灵感大放送

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