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植物转录组可发期刊直播_《十三号实验室》(2024年12月全新视觉)

内容来源：合毅科技所属栏目：导读更新日期：2024-11-30

植物转录组可发期刊

【“地表最强”？开启抵御超强辐射损害的理论依据——水熊虫，我国科学家成功破解】据央视新闻10月25日消息，今天凌晨，我国科学家基于水熊虫生存机制的相关研究论文在国际顶级学术期刊《Science》（《科学》）在线发表，为人类抵御超强辐射损害找到了理论依据。军事科学院军事医学研究院李磊博士介绍，水熊虫是一种水生无脊椎动物，躯体非常细小，它大部分体长不超过1毫米，主要分布在北极、热带、深海、温泉等世界各地，可以耐受超强辐射、高温、高压、低温、干燥等多种极端环境，水熊虫甚至可以在外太空真空环境中生存，因此具有很高的科学研究价值和生物医学价值。历经6年来的潜心研究，科研团队建立水熊虫的实验室培养体系，绘制其高质量基因组图谱，结合转录组、蛋白质组响应辐射的动态变化及关键分子功能和机制研究，揭示了耐受超强辐射的关键机制。军事科学院军事医学研究院副研究员杨冬介绍，从组学分析得到的2801个辐射相关变化相关基因中，我们进一步通过分子进化和功能特征分析，将抗辐射机制归为三类：一是从细菌、真菌、植物中水平转移到水熊虫中的外来基因，赋予了其特殊的抗逆能力；比如生成甜菜色素，起到抵抗活性氧的作用。二是缓步动物特异蛋白倾向于高度无序，通过相分离机制促进DNA损伤修复等过程；第三与其他门类共有的古老蛋白在水熊虫中具有特殊的辐射响应模式。军事科学院军事医学研究院研究员张令强表示，我们发现这些在水熊虫中起抗辐射保护作用的分子，转入人源细胞以后，可以显著提升人源细胞的抗辐射能力，也提示它们具有重要潜在应用价值，为研制人类抵御超强辐射损害的“金钟罩”找到了理论依据。据了解，多种涉核作业环境均受到超强辐射的严重威胁。针对水熊虫这种神奇的极端生命体抗逆机制的研究，将更新人类对生命系统基本构成原理和运行机制的认识，开启了全面认识超强辐射耐受机制的大门。 #最强生物水熊虫# #核辐射#

单细胞测序技术：揭秘生命科学的未来单细胞测序技术是一种在单个细胞水平上对基因组、转录组和表观组进行高通量测序分析的方法。它为我们揭示了生物体内单个细胞的奥秘。 𐟌𙠦Š€术原理单细胞捕获：通过重力捕获单个细胞，利用捕获芯片中的微孔确保每个微孔中只有一个细胞被捕获。 mRNA逆转录：细胞裂解后释放的mRNA与beads上的引物序列结合，进而逆转录为cDNA。文库构建与测序：回收beads后抓取cDNA进行文库构建、测序和分析。 𐟌𙠦Š€术优势揭示异质性：能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态，反映细胞间的异质性。高捕获率：捕获率可达到80%，检测细胞数量多，发现更多的细胞分群。高灵敏度与通量：超高通量，细胞捕获数最高可达到百万级。适用性强：适用于全物种、全样品类型，包括新鲜细胞、组织血液及石蜡样品等。 𐟌𙠥𚔧”詢†域肿瘤研究：对于癌症早期的诊断、追踪以及个体化治疗具有重要意义。发育生物学：如拟南芥和水稻等植物的基础研究，构建根系细胞的发育轨迹。微生物学：在细菌单细胞研究层面取得重要进展，如VITA高通量单细菌转录组产品。神经科学和植物学：具有广阔的应用前景。 𐟌𙠦Š€术发展趋势更低成本与更高通量：未来可能实现更低的成本和更高的通量、精度、准确度。多组学联合分析：整合转录组、基因组、表观组、蛋白组等多组学进行全面检测。时空维度整合：结合原位捕获、荧光标记和显微切割等技术，实现时空维度上的单细胞多组学研究。 𐟌𙠦•𐦍†析流程细胞识别与过滤：对捕获的细胞进行识别和过滤，确保数据的准确性。聚类分析：对细胞过滤后的表达谱进行聚类分析，得到细胞的聚类和降维结果。细胞类型预测：基于聚类结果进行细胞类型预测和注释。单细胞测序技术以其独特的优势，在生命科学研究中发挥着越来越重要的作用，为我们揭示了生物体内部单个细胞的奥秘。

深圳大学分享：大数据时代的生物学前沿这周五，我应邀前往深圳大学，为生物学专业的研究生们带来了一场精彩的讲座。我分享了大数据时代下如何解决生物学问题，以及数据库在其中扮演的重要角色。为了更直观地解释，我举了两个植物学的案例。数据库与数据：艺术馆与艺术品的关系 𐟎芊在生物学中，物种的信息可以通过五个维度的数据来定义：基因组、基因注释、转录组、变异数据和泛基因组。数据库的生物信息学研究人员就像艺术馆的策展人，他们的工作是整理和分类这些数据，让科研人员和商业公司更方便地从中提取所需知识。探究生物学问题的关键：比较 𐟔 在生物学研究中，“比较”是一个非常重要的工具。想要探究某个物种特征背后的机理和规律，就需要将其与另一个对立性状的样品进行比较。例如，探究花对称性的形成原因时，我们需要比较两侧对称花与辐射对称花的数据。研究腐生植物时，则需要比较腐生植物与非腐生植物的数据。在大数据时代，比较基因组学是一种有效的路径。案例一：兰科植物对称性的进化 𐟌𘊊达尔文认为，兰科植物从辐射对称向两侧对称进化，花对称性的变化使得兰科植物吸引更多不同种类的传粉昆虫，协同进化推动了兰科物种数量的爆发。通过比较深圳拟兰（辐射对称）与蝴蝶兰（两侧对称）的基因组数据，我们发现MADS-box基因家族的差异是导致兰科植物雌雄同体以及具有特化唇瓣的能力的关键。而且，基因组比较显示，兰科植物应该是由两侧对称向辐射对称演化，这修正了达尔文的理论。案例二：植物菌根共生的进化 𐟌🊊90%的植物都有菌根，其中一部分完全依赖真菌提供营养，这就是腐生兰花。通过比较完全腐生的兰花（紫金舌唇兰 Platanthera zijinensis）和部分菌根共生的兰花（广东舌唇兰 Platanthera guangdongensis），我们揭示了腐生兰花失去光合作用能力，失去叶片和根部，在黑暗中生存的分子机制。通过这些案例，我希望能够激发学生们对生物学前沿领域的兴趣，并鼓励他们积极探索未知的世界。

美国生物信息与生物技术顶尖院校推荐 𐟌𑥜觾Ž国研究生申请中，生物领域的相关专业一直备受青睐。今天，我们来详细介绍一下生物信息学和生物技术硕士专业及其热门院校。 𐟌🧔Ÿ物技术：该专业注重实践能力和创新能力培养，涉及生命科学、医学、环境科学等多个领域。它是一门结合了生物学、工程学、医学和植物科学的交叉型学科。 𐟌🧔Ÿ物信息：这个专业融合了生物学、计算机科学和统计学等学科，专注于利用计算机技术对生物数据进行收集、存储、分析和解释，以揭示生物学中的规律和模式。它涵盖了基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学等多个领域，是现代生物技术发展的重要支撑。 𐟓š以下是一些生物信息和生物技术的热门申请院校：加州大学欧文分校纽约大学威斯康星大学麦迪逊分校波士顿大学普渡大学罗切斯特大学欢迎大家一起分享和讨论美国留学的任何话题！

中国科学院大学学姐的生物学习方法分享大家好，今天我想和大家聊聊如何在生物学考试中拿到高分。作为一个刚刚上岸中国科学院大学的学姐，我觉得有些经验还是值得分享的，特别是对于那些觉得生物学难搞定的同学们。 “开放、综合”题型的应对策略 𐟌 首先，我们要明确一点，不论是生物化学还是细胞生物学，考试题目都不会超出你的知识范围。尤其是生物化学，它的知识点虽然多，但不会在深度上为难大家。考的基本都是基础知识。所谓“开放题”，在细胞生物学中出现的频率较高。这类题目主要通过深化对知识点的考察来测试你的掌握程度。细胞生物学是一个实验性很强的学科，很多技术都是围绕细胞形态、结构和功能的研究发展起来的。所以，这种题目主要看你能不能把某个实验技术应用到后面的学习中，是不是知道这个技术怎么用，遇到科学问题时用什么技术解决。综合题除了这种考察形式，还有一种常见的类型，就是让你论述某个领域的发展等。细胞生物学这本书虽然只有300多页，但里面的知识点相当丰富。有些知识点可能只是一带而过，但这些热点话题常常会出现在论述题中。比如2019年的论述题考了蛋白质组学和转录组学的应用和意义；2020年的真题则是用实验证明动植物的全能性。所以，所谓的“开放题”其实来源于课本，但又超越了课本，需要我们平时不断积累和总结。如何理解抽象知识点？𐟎슊对于一些很难理解、很抽象的知识点，尤其是生物化学的分子生物学部分，我建议大家可以在小破站或者某些网站上找一些生动的、讲解性的生命活动的动画视频。看了这些视频之后，你大概就能搞清楚这些生命活动是一个怎样的过程。当然啦，如果看到一些好的短视频，也会在生一考研的公主号中分享给大家，帮助大家更好地理解知识点。如何记忆复杂内容？𐟓𘊊理解了知识点之后，我们要如何记忆呢？要知道生物化学和细胞生物学都擅长用很复杂的一大段话去描述一个生理过程或生命活动。而图片和视频对我们大脑的冲击是更加深刻的。这里推荐给大家一种记忆方法——绘图记忆法。把文字转变成方便记忆的图片。比如在学习脂蛋白的体内运输时，大段文字简直让人头炸，试着把这个过程按照文字描述画下来，逻辑和整个生理过程就清楚多了。个代谢过程，包括TCA、糖酵解等过程一定要反复绘制整个过程图，这样记忆就轻松多啦！希望这些方法能帮到大家，祝大家都能在生物学考试中取得好成绩！

转录组测序关键点𐟌𑊨𝬥𝕧𛄦𕋥𚏯𜌥쨵𗦝妜‰点高大上，但其实它是你研究基因表达模式的重要工具。就像做任何实验一样，转录组测序也有一些需要注意的地方。下面我就来聊聊这些关键点，希望能帮到你。样品准备阶段 𐟌𞊩€‰择合适的样品：首先，你得确保你选的样品和你研究的目的匹配。比如说，你要研究某个特定组织的表达模式，那就得选这个组织的样品。植物的生长状态、组织的特异性以及表达水平的差异都要考虑进去。避免污染和降解：样品要尽量避免外界环境的污染和降解，保持RNA的完整性。这个很重要，因为RNA一旦降解，测序结果就会大打折扣。遵循三个原则：代表性、一致性和迅速性。样品要有代表性，能反映整体情况；一致性是指样品之间要有可比性；迅速性则是为了保持RNA的活性。 RNA提取和质量检测：使用高纯度的RNA样品，确保提取出的RNA完整、无降解、无污染。先评估样品的RNA含量和质量，采用合适的方法进行提取，比如酚/氯仿法或基于硅胶柱的提取方法。文库构建与测序阶段 𐟔슥ˆ𖥤‡cDNA文库：选择合适的文库构建方法，比如常规的RNA聚合酶链反应（RT-PCR）或纳米球技术（Next-Generation Sequencing）。注意选择适合的文库构建方法和质量控制。序列测定：选择合适的高通量测序平台进行测序，比如Illumina HiSeq或PacBio。测序深度和策略要取决于你的研究目的和预算。数据分析与结果解读 𐟓Š 基本数据质量评估和过滤：对测序数据进行基本的质量评估和过滤，确保数据的准确性和可靠性。生物信息学分析：包括基因表达量定量、差异表达分析和通路分析等。解读转录组测序结果时，需要结合已有的文献和数据库，寻找与研究目的相关的基因和通路信息。验证：验证关键基因的差异表达，可以通过实时荧光定量PCR（qRT-PCR）等方法。建议先尽量多做几个基因进行验证，比如20-40个基因，并注意选取的基因表达量不要过低。其他注意事项 𐟓‹ 生物学重复：生物学重复是生物实验所必须的，转录组测序也不例外。建议至少进行3次生物学重复。数据量与基因组大小：转录组测序所需数据量与所研究物种的基因组大小有关。基因组越大，所需数据量越大。常规物种一般建议6G数据即可；基因组较大的物种推荐8G以上数据，比如小麦建议10G数据起。运输与保存：组织样本在运输过程中应保持低温（4℃-16℃），避免直接置于液氮中以防止组织破裂。组织样本应储存在密封的容器中，并用棉花填充以防止震动造成的样本损坏。总之，遵循这些注意事项，可以确保你的转录组测序实验顺利进行和结果的准确性。希望这些建议对你有所帮助！

揭秘极端生命体水熊虫：为人类抵御超强辐射找到新希望！在地球的各个角落，从北极的冰川到热带的雨林，从深海的深渊到温泉的沸点，都生活着一种被称为“极端生命体”的微小生物——水熊虫。近日，我国科学家经过六年多的潜心研究，成功破解了水熊虫的生存机制，这一突破性成果不仅揭示了生命在极端环境下的顽强生命力，更为人类抵御超强辐射损害找到了理论依据，开启了生命科学研究的新篇章。水熊虫，学名为缓步动物，是一类微小的水生无脊椎动物，大部分体长不超过1毫米。它们分布广泛，几乎可以在地球上任何环境中生存，无论是高温、高压、低温、干燥，还是超强辐射、甚至外太空真空环境，水熊虫都能展现出惊人的生命力。这种强大的适应性源于其体内的各种生理机制和基因变异，使它们能够在极端环境中存活并繁衍。军事科学院军事医学研究院的张令强团队和杨冬团队，联合国内其他相关研究团队，经过长达六年多的潜心研究，成功建立了水熊虫的实验室培养体系，并绘制了其高质量基因组图谱。通过对转录组、蛋白质组响应辐射的动态变化及关键分子功能和机制的深入研究，科研团队揭示了水熊虫耐受超强辐射的关键机制。研究发现，水熊虫的抗辐射机制可以归为三类：一是从细菌、真菌、植物中水平转移到水熊虫中的外来基因，这些基因赋予了水熊虫特殊的抗逆能力，如生成甜菜色素来抵抗活性氧的损害；二是缓步动物特异蛋白倾向于高度无序，通过相分离机制促进DNA损伤修复等过程；三是与其他门类共有的古老蛋白在水熊虫中具有特殊的辐射响应模式。这一突破性成果不仅更新了人类对生命系统基本构成原理和运行机制的认识，更为研制人类抵御超强辐射损害的“金钟罩”找到了理论依据。科研团队发现，在水熊虫中起抗辐射作用的分子，转入人源细胞后，可以显著提升人源细胞的抗辐射能力。这一发现提示我们，水熊虫的抗辐射机制可能为人类在涉核作业环境、太空探索等超强辐射场景下提供有效的防护手段。当前，多种涉核作业环境均受到超强辐射的严重威胁，现有辐射防护策略对超强辐射缺乏有效防护。水熊虫抗辐射机制的发现，为开发新型辐射防护材料和技术提供了新思路。未来，随着对水熊虫抗辐射机制的深入研究，我们有望研制出更加高效、安全的辐射防护产品，为人类的健康和安全保驾护航。同时，水熊虫作为极端生命体的代表，其生存机制的破解也为生命起源、生命演化等生命科学领域的研究提供了新的视角和思路。我们有理由相信，在不久的将来，水熊虫将成为生命科学研究领域的一颗璀璨明珠，引领我们探索生命的奥秘和极限。

农艺与种业硕士的出路大家好！这里是岁岁打工日记𐟓š。今天我们来聊聊农学专业的就业方向，特别是作物遗传育种和农业信息学。希望这些信息能帮到正在迷茫的你！ 𐟌𑣀作物栽培】研究方向：耕作方式和栽培技术对植物产量和生长的影响；植物和土壤理化性质的测定，如光合作用、氮磷钾含量、产量测定等；田间实践，掌握栽培技术。就业对口：农业种业公司（如先正达、隆平高科、大北农、电商农业等）；农科院、农业局、农业推广所；教学科研行政（科研助理、教师编、公务员）。优点与缺点：每年招生较多，考研竞争相对较小；田间工作较多，实验辛苦，实验室工作相对较少；研究方向偏向大田，对口工作对农业依赖性较高。 𐟌𑣀作物育种】研究方向：传统育种、转基因育种和种质资源；传统育种：杂交育种等，耗时较长，涉及杂交种鉴定、分子标记测定等；转基因育种：诱变育种、分子育种、转基因组培等，涉及基因组学、遗传鉴定、WB、ELISA、CRISPR编辑、蛋白组/转录组测序；种质资源：群体性状及基因评估，结合生物信息与基因组学，涉及分子标记、物种集群、进化分析等。就业对口：大部分同作物栽培；各类生物类公司（如测序、生物原材料、IVD、生命科学、生物药）；做过免疫蛋白类实验的可以考虑CRO做多肽抗体一类；做过分子类实验的可以考虑IVD分子业务或者做基因靶点生物药公司；做过测序类实验的可以考虑生物测序、品种鉴定公司；做过质谱分析/IP-MS的可以考虑药企食品化学分析岗位。优点与缺点：湿实验较多，实验失败概率高；依旧需要下地，工作量可能和栽培差不多；后代遗传育种周期长，侧重作物应用，生物技术创新较少。篇幅有限，欢迎大家自行补充！下一篇将详细讲解农艺与种业/农业信息学的就业及行业整体薪资。如果你感兴趣，记得关注哦！

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